晴(🐑)朗(lǎng )时节，江户川(㊙)柯南（高山(⛓)南 配音）和(hé )(🥫)毛利小五郎（小山力也 配音）(🤳)、小(xiǎo )兰（山崎和佳奈 配音(👣)）以及(jí )少年侦探团的伙伴们一(yī )(💍)同(tóng )来(🐾)到京都，他(🏻)们即将登上自(zì )卫队(🃏)的宙斯盾(dùn )(🚶)战舰(jiàn )，体验一把出海作(🎥)战(🐡)的感觉(📧)，期(qī )间还结(jié )识(shí )了美丽又(🥤)有着(zhe )(👵)几分神(shén )秘的女(🏃)自卫队(duì )员(📐)藤井(🌂)七海(hǎi )（柴咲幸 配音）。谁(shuí )知快(kuài )乐(lè )的氛围很(👛)快被恐慌所替代，战舰(👚)上突然(rán )(👩)发现一条断掉的手臂(🎴)，消失的自卫(🏸)队(duì )员又引(yǐn )起军方的恐慌与(yǔ )(🍯)猜测。原来(🚪)某(🐌)国(guó )神(shén )秘间(👼)谍(😲)X已悄悄(qiāo )登上宙斯(sī )盾(🛌)，伺机盗取战(zhàn )舰上的(de )绝密(mì )情报。
　　为了找出(😋)隐藏的对手，柯南和灰原哀（林(🏚)原惠美(🎦) 配音）、阿笠博士(💱)（(🌛)绪方贤一 配(pèi )(✒)音）、服(fú )(👆)部平次(🏌)（堀川亮(liàng ) 配音）以及(🔄)远山和叶（宫(🐺)村(➗)优子(zǐ ) 配(pèi )音）通力合作，与间谍展开连(lián )番斗智斗勇的较(jiào )量…(👑)